Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVBQ9HBI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVBQ9HBI1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms