Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRKRIP1Q9H875 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRKRIP1Q9H875 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1Q9H875 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRKRIP1Q9H875 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1Q9H875 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms