Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1BQ9H816 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLRE1BQ9H816 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms