Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf56Q9H5V9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXorf56Q9H5V9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf56Q9H5V9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms