Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL31Q9H511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL31Q9H511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL31Q9H511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL31Q9H511 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL31Q9H511 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL31Q9H511 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL31Q9H511 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms