Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL3Q9H2J4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
PDCL3Q9H2J4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL3Q9H2J4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms