Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED28Q9H204 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED28Q9H204 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms