Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHARPINQ9H0F6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHARPINQ9H0F6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms