Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN1

ACTR6, Actin-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR6Q9GZN1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR6Q9GZN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR6Q9GZN1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTR6Q9GZN1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR6Q9GZN1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR6Q9GZN1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR6Q9GZN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR6Q9GZN1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms