Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM8Q9BZR9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM8Q9BZR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM8Q9BZR9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms