Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM54Q9BYV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM54Q9BYV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms