Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOL6Q9BWW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOL6Q9BWW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOL6Q9BWW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APOL6Q9BWW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOL6Q9BWW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOL6Q9BWW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms