Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT27Q9BW83 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT27Q9BW83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT27Q9BW83 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT27Q9BW83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT27Q9BW83 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT27Q9BW83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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