Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2Q9BVG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms