Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM43Q9BTV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM43Q9BTV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms