Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED2Q9BTP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED2Q9BTP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED2Q9BTP6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED2Q9BTP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED2Q9BTP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED2Q9BTP6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED2Q9BTP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms