Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRFN3Q9BTN0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRFN3Q9BTN0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRFN3Q9BTN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms