Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPY3Q9BT09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNPY3Q9BT09 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNPY3Q9BT09 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms