Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP44Q9BS26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERP44Q9BS26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ERP44Q9BS26 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms