Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP23Q9BRU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP23Q9BRU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP23Q9BRU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTP23Q9BRU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP23Q9BRU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP23Q9BRU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP23Q9BRU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms