Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS8Q99627 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS8Q99627 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS8Q99627 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms