Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK1Q96QP1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK1Q96QP1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK1Q96QP1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms