Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPG4P5Q96PW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPG4P5Q96PW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSPG4P5Q96PW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms