Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC115Q96NT0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC115Q96NT0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC115Q96NT0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms