Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOPNLQ96NB1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOPNLQ96NB1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOPNLQ96NB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms