Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00167Q96N53 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms