Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC17Q96LX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC17Q96LX7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC17Q96LX7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC17Q96LX7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC17Q96LX7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms