Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM8Q96KF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM8Q96KF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM8Q96KF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms