Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCHS1Q96JQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCHS1Q96JQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms