Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
LRRIQ1Q96JM4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.13■■■■□ 3.86
LRRIQ1Q96JM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRIQ1Q96JM4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
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