Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITCHQ96J02 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITCHQ96J02 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITCHQ96J02 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITCHQ96J02 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITCHQ96J02 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITCHQ96J02 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITCHQ96J02 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITCHQ96J02 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms