Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM3Q96HU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM3Q96HU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms