Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL48Q96GC5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL48Q96GC5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL48Q96GC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms