Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED8Q96G25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED8Q96G25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED8Q96G25 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms