Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3IP1Q96FE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3IP1Q96FE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms