Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP4Q96DX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP4Q96DX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP4Q96DX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP4Q96DX8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms