Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL29Q96CT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL29Q96CT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms