Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDCCAG3Q96C92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDCCAG3Q96C92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3Q96C92 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms