Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf49Q96BT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf49Q96BT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms