Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM43Q96BQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM43Q96BQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43Q96BQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms