Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L1Q96BA8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L1Q96BA8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms