Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKL1Q969V6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MKL1Q969V6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MKL1Q969V6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MKL1Q969V6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms