Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM54Q969K7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM54Q969K7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms