Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A1Q93096 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A1Q93096 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms