Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATA6Q92908 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATA6Q92908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GATA6Q92908 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms