Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROX1Q92786 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX1Q92786 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PROX1Q92786 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms