Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf50Q8WW18 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf50Q8WW18 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms