Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFT2D1Q8WV19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D1Q8WV19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFT2D1Q8WV19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFT2D1Q8WV19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D1Q8WV19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms