Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT2Q8TDY3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT2Q8TDY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT2Q8TDY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT2Q8TDY3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms