Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVIPQ8NHG7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms